Setelah melalui persiapan pendirian dan studi kelayakan, dengan surat nomor 010/KET/YMB/VI/85 tanggal 12 Juni 1985, yayasan mengajukan permohonan izin mendirikan Universitas Mercu Buana (UMB) kepada Kopertis Wilayah III. Berdasarkan surat nomor/ 15/ KOP.III/S.VI/85 yang ditandatangani oleh Prof. Dr. Boesjra Zahir (almarhum).
Pada tanggal 22 Oktober 1985 Universitas Mercu Buana secara resmi dinyatakan berdiri, dengan Fakultas dan Jurusan sebagai berikut:
Setahun kemudian, berdasarkan evaluasi Koordinator Perguruan Tinggi Swasta Wilayah III Indonesia, keenam jurusan tersebut mendapat status “Terdaftar” dari Menteri Pendidikan dan Kebudayaan, berdasarkan SK No 0507/0/1986.
Berbagai upaya penting dan strategis terus dilakukan. Selangkah demi selangkah, sejalan dengan upaya tersebut, Universitas Mercu Buana meningkatkan fasilitasnya. Karena kerja keras dan komitmen yang kuat, pada Dies Natalis VI tanggal 30 Mei 1991, berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No 0286/05/1191, Universitas Mercu Buana meraih status “Terakreditasi”, untuk:
Untuk mengantisipasi Surat Keputusan Mendikbud nomor 0686/U/1991 yang mensyaratkan di setiap universitas minimal terdiri dari 3 Fakultas Eksakta dan 2 Fakultas Sosial, maka melalui berbagai persiapan yang didahului dengan studi kelayakan, Universitas Mercu Buana mengembangkan fakultas dan jurusan baru. Maka pada tahun akademik 1994/1995 Universitas Mercu Buana telah mempunyai lima fakultas, yaitu
Kelima fakultas tersebut memiliki tiga belas jurusan.
Sejak tahun ajaran 1997/1998, berdasarkan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional nomor 001/BAN-PT/AK-1/VIII/1998 tanggal 11 Agustus 1998, dan nomor 008/BAN-PT/AK-IV/VI/2000 khusus untuk Fakultas Ilmu Komunikasi dan Teknik Informatika, memperoleh status “Terakreditasi” setelah dievaluasi pada tahun 2003 oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi.
Pada awal tahun akademik 1999/2000 Universitas Mercu Buana membuka Program Pascasarjana. Program pertama yang dibuka adalah Program Magister Manajemen. Dilandasi Surat Keputusan DIKTI Depdiknas nomor 30/DIKTI/KEP/2000, Program Magister Manajemen (MM) diselenggarakan dengan Konsentrasi
Pada tahun 2016 Universitas Mercu Buana juga telah membuka program Doktor pertamanya, yaitu program Doktor Manajemen.
Sejak bulan Desember 2016 Universitas Mercu Buana memperoleh Akreditasi Institusi Perguruan Tinggi (AIPT) dengan peringkat "A" atau Unggul dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT).
Pencapaian ini merupakan salah satu tonggak pencapaian/milestone Universitas Mercu Buana dan saat ini Universitas Mercu Buana sedang dalam proses untuk memperoleh akreditasi Internasional.